Rui Nepomuceno deixou "legado do seu empenho, da sua inteligência, da sua coragem na luta contra o fascismo e da autonomia da Madeira". É desta forma que o PCP assinala o falecimento do advogado e historiador.

O PTP manifestou pesar pela morte do historiador madeirense, assinalando o "seu papel de destaque na política regional e na esquerda madeirense".

Numa nota de imprensa, o partido expressou pesar pela morte de Rui Nepomuceno, endereçando sentidas condolências à família e amigos. O PTP assinalou que Rui Nepomuceno se manifestou desde cedo "contra a ditadura do Estado Novo"  tendo participado em lutas académicas contra o Salazarismo, sendo um defensor do sistema democrático e da luta anti-fascista até ao final dos seus dias.