“Além de um amigo pessoal foi um grande advogado. Tive o gosto e a honra de trabalhar com ele, sobretudo em direito criminal - trabalhei durante quase dois anos. Era uma pessoa afável, generosa, que tinha os seus ideais que nunca abdicou. Vou sentir muitas saudades”. É desta forma que presidente do Governo Regional manifesta o seu pesar pela morte de Rui Nepomuceno “um homem de uma integridade absoluta” e “ultra-culta”, enaltece.
O Bloco de Esquerda emitiu uma nota onde exprime o seu pesar pelo falecimento de Rui Nepomuceno, que, "para além de advogado e historiador, será sempre lembrado como um lutador pela liberdade, acérrimo defensor das suas causas e convicções e um autonomista convicto".
O Representante da República para a RAM emitiu uma nota de pesar pelo falecimento de Rui Nepomuceno, "distinto advogado e figura unanimemente respeitada da nossa sociedade". Ireneu Barreto recorda a forma empenhada como o advogado contribuiu para a consolidação da democracia na Região.